Ο Γιάννης Σμαραγδής μίλησε ανοικτά για τα στοιχεία μυθοπλασίας που ενσωμάτωσε στην ταινία του «Καποδίστριας» κατά τη διάρκεια συνέντευξής του στον Σταύρο Θεοδωράκη και την εκπομπή «Πρωταγωνιστές» στον Alpha. Ο σκηνοθέτης παραδέχθηκε ότι ορισμένες σκηνές, όπως η περίφημη σκηνή με τα κεράσια ή η συγχώρεση του δολοφόνου του Καποδίστρια, δεν ανταποκρίνονται πιστά στην ιστορία, αλλά επιλέχθηκαν συνειδητά για να υπηρετήσουν τη συγκίνηση και να αναδείξουν τον χαρακτήρα του πρώτου Κυβερνήτη της Ελλάδας.
Όπως εξήγησε, η σκηνή με τα κεράσια στόχευε να αναδείξει τον σεβασμό και την αγάπη που προκαλούσε ο Καποδίστριας στους ανθρώπους γύρω του, ενώ η σκηνή συγχώρεσης αντλήθηκε από το θεατρικό έργο του Νίκου Καζαντζάκη για τον Καποδίστρια, μεταφέροντας συμβολικά τη στάση του απέναντι σε προσωπικές αντιπαραθέσεις.
Ο Σμαραγδής αναφέρθηκε επίσης στις αρνητικές κριτικές που έχει δεχθεί η ταινία, σημειώνοντας ότι «βεβαίως και έχω ακούσει και πολύ άσχημα λόγια για την ταινία, όχι απλώς άσχημα. Δεν τα διαβάζω, μου τα λένε». Κατά την άποψή του, μεγάλο μέρος της κριτικής προέρχεται από ανθρώπους που δεν γνωρίζουν σε βάθος το ιστορικό πλαίσιο και σχολιάζουν χωρίς επαρκή γνώση.
Κλείνοντας, ο σκηνοθέτης έκανε μια αιχμηρή τοποθέτηση για την ιστορική αποτίμηση του Καποδίστρια, τονίζοντας: «Εγώ δεν μασάω τα λόγια μου. Την ιστορία του Καποδίστρια την έγραψαν οι άνθρωποι που τον δολοφόνησαν». Με την ταινία του, όπως υποστηρίζει, επιχείρησε να φέρει τον θεατή πιο κοντά στη συγκίνηση και το ανθρώπινο πρόσωπο του πρώτου Κυβερνήτη της Ελλάδας, ακόμη και μέσα από στοιχεία μυθοπλασίας.
