Η Ελλάδα συνεχίζει να εφαρμόζει έναν από τους πιο αυστηρούς και συστηματικούς ελέγχους υπολειμμάτων φυτοφαρμάκων στην Ευρωπαϊκή Ένωση. Το εθνικό πρόγραμμα ελέγχου, που υλοποιείται από τις Διευθύνσεις Αγροτικής Οικονομίας και Κτηνιατρικής και τα Περιφερειακά Κέντρα Προστασίας Φυτών και Ποιοτικού Ελέγχου, λειτουργεί αδιάλειπτα από το 1996.

Κάθε χρόνο συλλέγονται περίπου 3.500 δείγματα από λαχαναγορές, σούπερ μάρκετ, λαϊκές αγορές, οπωροπωλεία, αποθήκες και συνοριακούς σταθμούς, τα οποία αναλύονται με σύγχρονες μεθόδους στο Μπενάκειο Φυτοπαθολογικό Ινστιτούτο και στα Περιφερειακά Κέντρα. Τα αποτελέσματα δείχνουν ότι η συντριπτική πλειονότητα των προϊόντων είναι ασφαλής. Το 2024, από 3.759 δείγματα, μόνο το 3,24% κρίθηκε μη συμμορφούμενο και το 0,96% δυνητικά επικίνδυνο για την υγεία.

Το 2025 οι έλεγχοι συνεχίζονται εντατικά, με πρόστιμα και ανακλήσεις προϊόντων σε περιπτώσεις παραβάσεων. Τα πρόστιμα κυμαίνονται από 1.000 έως 60.000 ευρώ ανάλογα με τη σοβαρότητα της παράβασης, συνοδευόμενα από κατασχέσεις και καταστροφή προϊόντων. Μέχρι σήμερα έχουν επιβληθεί πρόστιμα ύψους 202.000 ευρώ.

Η Ελλάδα πραγματοποιεί περισσότερους ελέγχους αναλογικά με τον πληθυσμό σε σχέση με τον μέσο όρο της ΕΕ, γεγονός που αναδεικνύει τη σημασία που δίνεται στην ασφάλεια των τροφίμων και την προστασία των καταναλωτών. Οι έλεγχοι καλύπτουν όλη την αλυσίδα παραγωγής και διακίνησης, διασφαλίζοντας ότι τα επικίνδυνα προϊόντα δεν φτάνουν ποτέ στο τραπέζι των πολιτών.